Bei Mykosen handelt es sich um Krankheiten, die durch die Infektion mit Pilzen zu stande kommen. Diese Pilze können entweder endogen, also beispielsweise aus dem eigenen Verdauungstrakt sein, oder aber auch exogene Pilzarten, welche als primär pathogen gelten. Weiters unterscheidet man je nach Lokalisation der Infektion, Hautinfektionen (Dermatomykosen), tiefe Mykosen (viszerale bzw. subkutane Mykosen) und Systemmykosen.